فريق متكامل من خبراء جراحة الكبد والجهاز الهضمي والمناظير الجراحية يقوم بإجراء كافة التدخلات الجراحية المطلوبة لمرضى الكبد والجهاز الهضمي من خلال غرف عمليات مجهزة بأحدث الأجهزة والتقنيات للوصول لأفضل النتائج.
العديد من التدخلات الجراحية البسيطة والمتقدمة يمكن اجراؤها مثل استئصال اورام الكبد الخبيثة والحميدة واستئصال أكياس وخراجات الكبد واستئصال المرارة بالمنظار الجراحي وإصلاح الفتاق واستئصال الطحال.
كما يتم اجراء الجراحات عالية الدقة مثل زراعة الكبد وإعادة توصيل وبناء القنوات المرارية.
أيضا يقوم القسم بأجراء جراحات استئصال اورام المريء والمعدة واورام القولون والمستقيم واستئصال وإعادة توصيل الأمعاء وحالات الانسداد المعوي.
إضافة لهذا أيضا هناك العديد من التدخلات الجراحية البسيطة يمكن اجراؤها مثل تفريغ التجمعات والخراجات واستئصال الأورام السطحية واخذ العينات الجراحية مثل حالات تضخم الغدد الليمفاوية.
يقوم الفريق الطبي بالقسم بمناظرة وتقييم كامل للحالات قبل التدخل الجراحي ومن ثم اخذ القرار المناسب وتنفيذه ومتابعة المرضى حتى تمام الشفاء.
يتم اجراء التدخلات الجراحية بالمعهد على نفقة الدولة او بخطاب تحويل من جهات متعاقدة مثل التأمين الصحي او بشكل مجاني.